uc:sendtilenven runat server id uc_sendtilenven
Ændre størrelse på tekst Print

Statistics for bioinformatics and eScience (StatBI/E)


Semesterangivelse: Efterårs kursus Kurset udbydes i blok 2 Kurset udbydes i skemagruppe C Kurset giver 7,5 ETCS point

 


Udgave: Efterår 2012 NAT
Point: 7,5
Blokstruktur: 2. blok
Skemagruppe: C
Fagområde: mat

Semester:

Efterår
Varighed: 9 uger.
Institutter: Institut for Matematiske Fag
Uddannelsesdel: Kandidat niveau
Kontaktpersoner: Carsten Wiuf, tlf. 35 32 06 95, rum 04.3.05, email: wiuf@math.ku.dk
Skema- oplysninger:  Vis skema for kurset
Samlet oversigt over tid og sted for alle kurser inden for Lektionsplan for Det Naturvidenskabelige Fakultet Efterår 2012 NAT
Undervisnings- periode: 19. november 2012 – 27. januar 2013
Undervisnings- form: 5 timers forelæsning og 3 timers øvelser om ugen.
Indhold: Kurset er baseret på et antal konkrete cases, der vil bringe deltagerne igennem de følgende emner.
Standard diskrete og kontinuerte fordelinger, deskriptive metoder, den frekventistiske og Bayesianske fortolkning, betingning, uafhængighed, og udvalgte sandsynlighedsteoretiske resultater. Simulation.
Middelværdi, varians, estimatorer, to-stikprøve sammenligninger, multiple test. Maksimum likelihood og mindste kvadraters metode til estimation. Standardfejl og konfidensintervaller. Bootstrapping.
Korrelation, lineær, ikke-lineær, logistisk og Poisson regression. Dimensionsreduktion, modelselektion og modelvalidering.
Det statistiske programmeringssprog R.
Modeller for neuronaktivitet, genekspression, databasesøgninger, motiv- og ordforekomster, internettraffik, diagnostiske test o.lign.
Målbeskrivelse: Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne
1) Opsummere empiriske data og beregne relevante deskriptive størrelser for diskrete og kontinuerte fordelinger.
2) Anvende generelle metoder, såsom mindste kvadraters metode og maksimum likelihood, til at tilpasse en sandsynlighedsfordeling til empiriske data.
3) Vurdere en tilpasset fordeling med deskriptive metoder.
4) Formulere videnskabelige spørgsmål i statistiske termer.
5) Undersøge videnskabelige spørgsmål, der er formuleret som en sammenligning mellem fordelinger eller parametre, med statistiske metoder.
6) Undersøge videnskabelige spørgsmål angående sammenhæng i termer af lineær, ikke-lineær, logistisk og Poisson regression.
7) Vurdere hvorvidt en regressionsmodel er valid baseret på diagnostiske størrelser og plots.
8) Beregne prediktioner baseret på regressionsmodeller, der tager hensyn til den usikkerhed prediktionerne er forbundet med.
9) Beregne usikkerhedsmål, såsom stadardfejl og konfidensintervaller, for estimerede parametre.
10) Bruge computersimulationer, herunder bootstrapmetoder, til beregninger med sandsynlighedsfordelinger.
11) Fortolke og rapportere konklusionerne af en praktisk dataanalyse.
12) Beherske den praktiske implementation i R for at nå de ovenfor angivne mål.
Lærebøger: Peter Dalgaard. Introductory Statistics with R, 2nd edition. Desuden handouts.
Tilmelding: Kursus- og eksamenstilmelding og afmelding sker på www.kunet.dk Tilmelding skal ske i perioden den 15. maj – 1. juni 2012.
Faglige forudsætninger: Kandidatstuderende eller bachelorstuderende på 3. år med MatIntro eller et tilsvarende kursus.
Eksamensform: En afsluttende, individuel, to-dages, tag-hjem eksamen, intern censur, karakter efter 7-trinsskalaen. En forudsætning for at gå til eksamen er godkendelse af en obligatorisk opgave i løbet af kurset, der skal løses i grupper af 2-4 studerende. Karakteren gives alene på baggrund af den individuelle eksamen.
Re-eksamen: samme som ordinær.
Eksamen: 2 dages hjemmeopgave udleveres den 15. januar 2013 og afleveres den 16. januar 2013. Reeksamen: 2 dages hjemmeopgave udleveres den 16. april 2013 og afleveres den 17. januar 2013.
Kursus hjemmeside:
Bemærkninger: Kurset er obligatorisk på kandidatuddannelserne i bioinformatik og eSciece. Kurset kan også tages af andre studerende ved naturvidenskab, der ønsker en introduktion til statistik på kandidatniveau. Det kan også tages af matematikere, dataloger og andre, der ikke har taget kurserne Sand1 og Stat1. De studerende forventes at medbringe en bærbar computer med trådløs internetadgang til alle forelæsninger og øvelser. Programmet R er gratis tilgængeligt.
Undervisnings- sprog: Engelsk
Sidst redigeret: 25/4-2012



Københavns Universitet