|
| Udgave: |
Forår 2013 NAT |
| ECTS points: |
15 |
| Point: |
15,0 |
| Blokstruktur: |
3. blok |
| Fagområde: |
andet |
Semester: |
2. år, blok 3 |
| Varighed: |
7 uger |
| Institutter: |
Biologisk Institut |
| Uddannelsesdel: |
Bachelor niveau |
| Kontaktpersoner: |
Qunxin She, qunxin@bio.ku.dk, tlf. 3532 2013 |
| Skema- oplysninger: |
Skema endnu ikke afgjort - siden opdateres løbende. |
| Skema- oplysninger: |
 Vis skema for kurset
Samlet oversigt over tid og sted for alle kurser inden for Lektionsplan for Det Naturvidenskabelige Fakultet Forår 2013 NAT |
| Undervisnings- form: |
Forelæsninger og eksaminatorier. Der vil desuden være afsat tid til forberedelse og opgaveregning. |
| Indhold: |
Kurset gennemgår vigtige principper i biokemien og vil være baseret på en gennemarbejdning af mekanismerne bag klassisk molekylærbiologi, dvs. nukleinsyrekemi, DNA replikation og reparation, homolog DNA rekombination, transskription samt translation. Proteinkemiundervisningen omfatter proteiners kemiske og strukturelle egenskaber, foldning, stabilitet, og nedbrydning, protein-protein interaktioner, rekombinant proteinekspression, metoder til proteinoprensning og karakterisering, co- og post-translationelle modifikationer, proteindatabaser og basal in silico sekvens- og strukturanalyse, samt udvalgte eksempler til illustration af sammenhængen mellem proteiners struktur og funktion i en cellulær kontekst. |
| Målbeskrivelse: |
For at få karakteren 12 skal den studerende kunne:
Molekylærbiologi:
Redegøre sikkert og overbevisende for de molekylære mekanismer i de basale processer som foregår i celler fra livets tre domæner (bakterier, archaea og eukaryoter), herunder DNA replikation, DNA reparation, RNA transkription, og protein biosyntese i ribosomet.
Identificere og velbegrundet relatere de forskellige mekanismers indbyrdes sammenhæng
Forstå og redegøre overbevisende for regulering af genekspression, processering af RNA, og splejsning af RNA molekyler
Forstå og redegøre sikkert for struktur og funktion af DNA og RNA og mekanismer for transposition
Forstå og redegøre sikkert for de regulatoriske mekanismer baseret på små RNAer.
Proteinkemi:
Redegøre for aminosyrers fysisk-kemiske egenskaber, samt proteiners kemiske og strukturelle egenskaber (primær, sekundær, tertiær og kvarternær struktur, konformation, supersekundære motiver og proteinklasser).
Forstå og redegøre for begreber som domæne, samt similaritet og homologi på både sekvens- og strukturniveau.
Kende centrale sekvens- og strukturdatabaser, og anvende disse til basal karakterisering af en proteinsekvens på forskellige strukturniveauer.
Forstå og redegøre for basale principper indenfor proteinfoldning, stabilitet og nedbrydning samt ubiquitin-proteasomsystemet.
Forstå principperne for membranproteiners strukturelleopbygning.
Forklare principperne for protein-ligand og protein-protein interaktioner, forstå og redegøre for grundlæggende begreber (dissociationskonstant, kooperativitet, aviditet), samt kunne foretage basal kvantitativ analyse af bindingsdata (Scatchard plot).
Kende principperne for, samt vurdere fordele og ulemper ved, heterolog proteinekspression i forskellige organismer.
Forstå og redegøre for basale oprensnings- og analyseteknikker så som forskellige kromatografiske metoder, SDS-PAGE, fluorescens- og CD-spektroskopi, samt proteinstrukturbestemmelse ved NMR-spektroskopi og røntgenkrystallografi.
Kende co- og post-translationelle modifikationer og beskrive deres indflydelse på proteiners struktur og cellulære funktion.
Beskrive udvalgte eksempler på hvordan specifikke proteiners struktur relaterer til deres funktionelle egenskaber i en cellulær kontekst.
|
| Lærebøger: |
1. Hartwell et al.: Genetics - from Genes to Genomes, 4th edition, McGraw-Hill, 2011;
2. Arthur M. Lesk: Introduction to Protein Science: Architecture, Function, and Genomics (second edition). Oxford University Press. |
| Tilmelding: |
Tilmelding foregår på selvbetjeningen på KUnet i perioden 15. november til 1. december. |
| Faglige forudsætninger: |
Pensum i alle 1. års kurser samt Biokemi1 forudsættes bekendt. |
| Formelle krav: |
Alle kurser beliggende i 1. års blok 1 og 2 i studieordningen for bacheloruddannelsen i biokemi skal være bestået. Øvelsesdelen af Biokemi1 skal være godkendt. |
| Eksamensform: |
Skriftlig 4 timers prøve uden hjælpemidler med ekstern censur. Karakter efter 7-trins-skalaen. Reeksamen: Afholdes ligesom den ordinære eksamen. |
| Eksamen: |
Skriftlig prøve d. 9. april 2013.
Reeksamen: Skriftlig prøve d. 25. juni 2013. |
| Kursus hjemmeside: |
 |
| Bemærkninger: |
Visse forelæsninger kan være på engelsk, men eksamen vil kun blive formuleret på dansk.
Fordelingen på eksaminatoriehold vil blive annonceret på kursets hjemmeside. |
| Sidst redigeret: |
26/10-2012 |